تضمن قانون صندوق الوقف الخيرى عددا من الأهداف أبرزها المساهمة في نشر الدعوة الإسلامية بالداخل والخارج، أبرزها معاونة أجهزة الدولة في إقامة مشروعات خدمية وتنموية خاصةً التعليمية ، والمساهمة في تطوير مشروعات البنية التحتية وكافة المشروعات التي تسهم في دعم الموقف الاجتماعي والاقتصادي للدولة .

ووفقا للقانون، من اهم الأهداف أيضا المساهمة في تطوير العشوائيات ، المساهمة في الحد من ظاهرة أطفال بلا مأوى والمشردين ، المساهمة في الحالات الأولي بالرعاية ويصدر بتحديدها قرار من مجلس إدارة الصندوق بناءً علي عرض وزير الأوقاف، وذلك كله في حدود شروط الواقفين .

الجدير بالذكر ان القانون نص على" ينشأ صندوق يسمي «صندوق الوقف الخيري» تكون له الشخصية الاعتبارية ويتبع رئيس مجلس الوزراء ويكون مقره مدينة القاهرة وله أن ينشئ فروعًا أخري في جميع أنحاء الجمهورية ، ويشار إليه في هذا القانون بالصندوق ".